(1) Sti- og gangsytemer

Stisystemerne istandsættes i hele Botanisk Have, så gangbesværede kan få større glæde af haven.

(2) Nedrivning af bunkers

De gamle bunkers langs Gothersgade rives ned, hvilket giver adskillige ekstra kvadratmeter til haven.

(3) Observatoriehøjen

Botanisk Have udvides, når Observatoriehøjen gøres til en del af haven. Hegnet mellem Observatoriet og haven nedlægges, og det ydre hegn langs Øster Voldgade forlænges. Der vil ikke længere være publikumsadgang til Observatoriet fra gaden, men i stedet fra Botanisk Have.

De oprindelige sigtelinjer genetableres, så man kan se ud over Botanisk Have på den ene side og indre by med dens mange smukke tårne og spir på den anden side. Arealet vil kunne bruges til opholds- og pauseplads for skoleklasser, børnehaver m.fl.

(4) Dansk Kvarter

Kampestens-støttemurene omkring Dansk Kvarter renoveres, og der etableres et lille amfiteater med tilhørende brodæk, som kan bruges til ophold, foredrag og arrangementer. Mens arbejdet står på opbevares plantesamlingen i havens frøbank og som udplantede småplanter rundt om i Haven. Den danske plantesamling flyttes tilbage til Dansk Kvarter i foråret 2012.

(5) Staudehave og brombærhave

Staudekvarteret omlægges og istandsættes. Brombærsamlingen flyttes til denne del af haven, så den bliver mere synlig for publikum. Pergolaerne fornys, og der laves nyt espalier til opbinding af planter. Staudesamlingen omplantes midlertidigt i den store plæne ved Palmehuset og flyttes tilbage til staudekvarteret i efteråret 2011.

(6) Renovering af stenhøjene

Stierne på Stenhøjen får ny granitbelægning og alle trapper istandsættes, så de bliver bedre at færdes på. Opholdspladserne på Stenhøjens toppe udvides, og der ryddes ud i dubletter af store buske og træer, så der bliver bedre udsigt fra højen og ud over haven. Vandingsanlægget fornys, så der kan vandes bedre og mere intensivt på sarte stenhøjsvækster. Arbejdet afsluttes i sommeren 2012.

(7) Omlægning af arealer og stier 
foran Palmehuset

Pladsen omkring spejlbassinet nedenfor palmehusene udvides, og der tilføres ny, fast belægning med majsfarvet "asfalt" således, at arealet kan bruges til mindre koncerter, receptioner og andre arrangementer. Stiføringen igennem Rhododendron-kvarteret omlægges og føres tilbage til sit oprindelige, romantiske, kurvede forløb, som da Haven blev anlagt.

(8) Omlægning af arealerne ved
Nørreport-indgangen

Arealerne indenfor hovedindgangen ved Nørreport omlægges således, at de bliver mere åbne, imødekommende og velegnede som mødested for rundvisningsgrupper, skoleklasser og andre, som har aftalt at gå en tur i Haven.

(9) Etablering af rekreative områder

Der omlægges og nyanlægges en række steder  rundt omkring i Haven, der vil være velegnede til ophold:

Der etableres brodæk og mini-amfiteater ved søen med plads til 30-40 siddende personer.

Raftehegnet omkring den tidligere alpin-afdeling rives ned, og haverummet nord for staudekvarteret foran væksthus 26 & 27 gøres tilgængeligt for publikum. Det indrettes til ophold med bænke samt græs- og grusarealer.

Som forsøgsordning udpeges der græsarealer, hvor ophold er tilladt; bl.a akaciehøjen på vestsiden af søen og området med piletræer mellem palmehuskomplekset og søen.